советский разведчик, ветеран Второй мировой войны, Герой Российской Федерации (2007). Согласно одной из версий, сыграл значительную роль в сохранении Кракова от разрушения германскими войсками. Также как и Е. С. Березняк является прототипом главного героя фильма «Майор Вихрь».
Вырос в крестьянской семье, проживавшей на территории Западной Белоруссии, в Воложинском районе Минской области, которая в марте 1921 г. отошла к Польше. По окончании школы был призван в польскую армию, в составе которой, командуя расчетом зенитного орудия, в сентябре 1939 г. участвовал в боях с немцами. Под Варшавой сбил три самолета Junkers. Когда в 1939 г. восточные районы Польши заняли советские войска, стал гражданином СССР, преподавал в начальной школе. В 1940 г. Был направлен на службу в органы НКВД СССР, в 1941 г. окончил разведывательную школу. В июле 1941 г. Был зачислен в состав Отдельной мотострелковой бригады особого назначения, подчинявшейся четвертому управлению НКВД СССР. В ноябре 1941 г. в качестве командира разведывательно-диверсионной группы переброшен за линию фронта. Участвовал в обороне Москвы. В 1942 г. Был направлен в глубокий тыл врага в западные районы Украины и Белоруссии. Действовал там как самостоятельно, так и в составе крупных партизанских отрядов. Был заместителем по разведке командира партизанского соединения Героя Советского Союза В. А. Карасева. Под его непосредственным руководством проведена операция по взрыву немецкого гебитскомиссариата в Овруче Житомирской области Украинской ССР, когда там находилась инспекция из Германии. В результате этой операции 9 сентября 1943 г. уничтожено 80 гитлеровских офицеров. За эту операцию был представлен к званию Героя Советского Союза, но награды тогда не получил. В мае 1944 г. по заданию Центра во главе группы из 28 человек совершил переход в Польшу, имея задачу организации разведки расположения и передвижения противника в районе города Кракова. Благодаря хорошему знанию польского языка и культуры местного населения, а также своим организаторским способностям, сумел организовать взаимодействие и совместные боевые операции с такими разными политическими силами, как части Армии Крайовой, Армии Людовой и крестьянскими Батальонами Хлопскими. Под его руководством была проведена операция по захвату совместно с подразделениями Армии Людовой города Илжа, в ходе которой из тюрьмы были освобождены арестованные польские патриоты, захвачено большое количество оружия и снаряжения. Группе удалось обосноваться в районе Кракова и развернуть широкую разведывательную и диверсионную деятельность. В конце 1944 г. бойцами группы был захвачен инженер-картограф Зигмунд Огарек, этнический поляк, мобилизованный в состав гитлеровской армии и служивший в тыловых подразделениях вермахта. Огарек дал ценные показания о складе взрывчатки в Ягелонский замок, которую, по одной из версий, предполагалось использовать для уничтожения исторического центра Кракова, Рожновской плотины и мостов через реку Дунаец. Ботяну удалось внедрить в замок под видом грузчика польского патриота, который установил мину замедленного действия. В разгар наступления Красной Армии утром 18 января 1945 г. мина была приведена в действие и вражеский склад взлетел на воздух. На следующий день, 19 января в Краков вошли передовые части 1-го Украинского фронта под командованием Маршала Советского Союза И. С. Конева. Город практически не пострадал в ходе боевых действий (было взорвано лишь несколько мостов через Вислу).
Роль Ботяна в сохранении Кракова во время Второй мировой войны ставится под сомнение в современной Польше. В последние месяцы войны его группа действовала в тылу врага на оккупированной территории Чехословакии. С 1945 г. проходил службу в оперативном составе 1-го Управления (внешняя разведка) Наркомата государственной безопасности СССР. Неоднократно выезжал в заграничные командировки в различные европейские страны для выполнения сложных и ответственных заданий, сведения о которых еще засекречены. Привлекался для консультирования сотрудников группы специального назначения «Вымпел». В 1983 г. в звании полковника был уволен в отставку по возрасту. До 1989 г. продолжал работать в органах КГБ СССР в качестве гражданского специалиста.
В 2017 году по случаю 95-летия со дня образования управления «С» ПГУ КГБ СССР один из драгоценных камней, хранящийся в Гохране России, был назван именем Алексея Ботяна.
В 2020 году издана почтовая марка России, посвящённая А. Н. Ботяну.
7 октября 2021 года на месте захоронения на Троекуровском кладбище открыт бюст.
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 30 ноября 2021 года № 3397-р на основании предложения парламента Республики Северная Осетия — Алания наименование «Алексей Ботян» присвоено безымянной горе абсолютной высотой 4019 метров, расположенной на хребте Соудор на территории Ирафского района Республики Северная Осетия – Алания.